有些患者经皮肝穿刺术后会出现短暂的肝区痛或肝穿刺部位疼痛，但一般反应轻微，可不必处理，经过24小时后多可自行缓解。目前有些医院已采用B超引导下的细针穿刺，其优点是损伤小、定位准确，对确定肝内占位性病变的性质特别适用。有些患者认为肝穿刺会损伤"元气”，需要做肝穿刺时，往往精神非常紧张、顾虑重重，术后也常感到诸多不适。而当医生向患者做详细的解释之后，很多患者不适感会很快消失，这说明精神因素占有很大比例。但是当患者有出血倾向或其他禁忌证时，则应缓做或不做肝穿刺。