戊型肝炎病毒经口腔侵入人体，从肠道经门静脉感染肝细胞，在肝细胞浆内进行增殖复制，复制后的病毒颗粒散布于肝细胞质基质中，并通过分泌作用进入胆汁中。病毒在肝内进行一次性繁殖，并在潜伏期及急性期出现短暂的病毒血症。病毒主要随胆汁通过粪便排出体外。在肝外是否也存在戊型肝炎病毒繁殖尚不清楚。戊型肝炎发病经治疗后，病毒在2周左右逐渐从粪便中消失，带病毒的粪便可再次经口感染他人。