庚型肝炎临床上表现为急性肝炎特点，缺乏明显特异性，具有一般病毒性肝炎的症状和体征，如纳差、恶心、右上腹部不适、疼痛、黄疸、肝肿大、肝区痛等。

庚型肝炎病毒可导致急性、慢性肝炎和携带状态。慢性感染的病理特点与丙型肝炎相似。与丙型肝炎同时感染时，庚型肝炎病毒极易形成慢性持续感染，感染时间可长达数年。庚型肝炎病毒感染后多数临床症状较轻，黄疸比丙型肝炎少见。有些患者血清ALT水平轻度升高，而近50%的感染者ALT正常。